玄武门兵变之后，谏议大夫魏征多次劝李世民安抚李建成、李元吉属下。李世民于是派魏征到山东各地安抚，并授权他见机行事。魏征奉命出发，路上遇见太子旧将李志安和齐王旧将李思行，都由地方官押着要送住京师。魏征感慨道：“高祖已经下了赦免的诏书，现在又押这两个人进京，这赦书不是白下了吗，以后天下人还能相信诏书吗？”当时就把两个人给放了，然后上报李世民。李世民欣赏他有见识，传令奖励，同时又下令，凡是有关东宫、齐王以及江王李瑗的事情，都不准再乱告，违令者严惩。从此再没人告密，朝廷渐渐安定了。
当时，还有一段风流韵事。李元吉死时只有二十四岁，妃子杨氏与李元吉年纪相当，长得体态风流，性情柔媚，面如出水芙蓉，腰似迎风杨柳，唐室王妃中数这个杨妃最漂亮。杨妃平时与秦王妃长孙氏交情很好，往来非常融洽。李元吉谋害李世民的时候，她曾经谏言阻拦，请求李元吉不要和李世民结仇，偏偏李元吉不听，最终落得家破人亡，儿子也一起被杀。杨氏年轻貌美，独守空房，又没有别的亲人，怎能耐得住寂寞呢？幸亏长孙氏念及妯娌情谊，不时邀她过来叙旧，好言劝慰，排解忧愁。
一天，妯娌俩正在聊天，李世民从外面进来，杨氏竟然跪下向李世民请死，弄得李世民一时不知如何是好。长孙氏急忙在一旁劝解，杨氏娇声啼哭，越发楚楚可怜。李世民虽是盖世英雄，这时也不禁动了情，替她感到凄楚。又看她淡妆浅抹，一副秀色可餐的样子，不禁魂不守舍，忙站起来连声说请起。长孙氏也过来搀扶，好不容易才把杨氏拉起，杨氏还是哭个不停，李世民这才说：“王妃不必过于悲伤。齐王谋反应该伏法，与王妃无关。我只要在位一天，定会保护王妃一天，不要过虑了！如果嫌在府中寂寞，不如搬过来，好在你们妯娌俩关系和睦，我也就不担心了。”又嘱咐长孙氏好好相待。
长孙氏一向性情温和，对长辈极尽孝道，对李世民也从不违抗。她和杨氏本来关系就好，听到李世民吩咐，也乐得劝她搬来东宫，自己也好多个伴儿。杨氏当然唯命是从，第二天就搬了过来。哪知这位新任的太子却看上了这位娇滴滴的弟媳妇，特地收拾了一间干净的屋子，一切布置都亲手安排，又暗中调了几个心腹侍女作为杨氏的丫鬟。杨氏非常高兴。李世民没事的时候经常到她屋里聊天，二人日久生情，竟然耳鬓厮磨起来。
一天半夜，杨氏已经就寝，李世民在李渊那里喝了点酒，竟然借着酒劲来到杨氏门前，杨氏连忙起身迎客。这时正是中秋，皓月当空，再加上烛光高照，光线很好。李世民就在这月光、灯光下面，定睛瞧着杨氏，只见她云鬓半卷，双目含情，穿一身白色，虽然没化妆，却更显出花容明媚。杨氏看见李世民盯着自己瞧，也不禁冲他一笑。李世民却转眼看着明月道：“不如我们一起赏月吧。”侍女弄了酒菜，二人登楼赏起月来。古人说得好：“酒是色媒，色为酒媒。”杨氏开始还有三分腼腆，等到酒过三巡，渐渐地就忘了什么是羞涩。再仔细看李世民，更觉得他风流倜傥，英姿潇洒，眉宇清秀，禁不住心猿意马起来。李世民便道：“夜已深了，再饮一杯就撤席吧。”侍女撤下酒席出去，剩下这两个人又坐一会儿，然后进了卧室，想必是上演龙凤配去了。第二天早晨李世民才离开。
过了几天，高祖下诏禅位，从此高祖自称太上皇，皇位传给太子李世民。八月甲子日李世民登上皇位。这天黎明，李世民先朝见了高祖，接受玉玺，然后返回到东宫显德殿，面南升座，接受文武百官的朝贺。接下来派左仆射裴寂祭告南郊，大赦天下，赐文武百官爵位，百姓减租两年，免庸、调一年，百姓八十岁以上的赐给粮食布匹，到一百岁的再加倍赐给。依次颁发了各种恩赐的诏书，然后退朝回宫，历史上称为唐太宗。
十几天之后，长孙氏被册封为皇后。长孙氏从小就爱读书，知书达理，当了皇后以后，崇尚节俭，起居服饰从不奢华。太宗继位后，曾经与她谈起新政，皇后沉默不答。李世民再三追问，皇后温和地说：“我是个妇人，只管宫中的事。怎么敢参与朝政呢？”太宗从此更加敬重皇后。
唐太宗放不下杨氏，居然将她纳为皇妃，而且越来越宠爱。皇后这才后悔没有早点防备，导致犯下大错，但木已成舟，也没办法阻止了。皇后通情达理，对待杨氏依然很好，只不过改换称呼。杨氏开始还觉得不好意思，后来渐渐地习惯，也就不在意了。太宗既然纳了杨氏，也就不得不赦免李元吉，接着又赦免了李建成，于是追封李建成为息王，谥号隐太子，追封李元吉为海陵郡王，都按皇亲的礼数重新安葬。
突厥首领颉利可汗是个反复无常的家伙，与唐朝一会儿和好，一会儿开战。苟延残喘的伪梁帝梁师都多次怂恿突厥侵扰大唐的边境，于是颉利、突利两个可汗再次合兵十多万人马大举进犯。先攻打泾州，然后攻打武功。太宗下诏严防，又任命尉迟恭为泾州道行军总管领兵出击。尉迟恭到了泾阳，正好与突厥兵相遇，就乘着锐气杀了过去，突厥兵抵挡不住，被他横冲直撞地击毙一千多人，狼狈败走。尉迟恭收军后，颉利可汗又从小路来攻渭水，在便桥扎下大营，先派心腹大将执失思力到京师拜见太宗，探听虚实。太宗召见执失思力，问他为什么进犯大唐。执失思力道：“贵国给我们的金银每年都没有定额，有时给，有时不给，没有诚意，所以我国两位可汗特地带兵百万，前来请命。”太宗凛然呵斥道：“朕与你们的可汗当面约好和亲，赠送金银不计其数，现在你们可汗违背盟约，带兵进犯，你们背信弃义，我们仁至义尽。你们虽然居住在蛮荒之地，也应该有人性，怎能恩将仇报呢？现在就把你的脑袋砍了，然后再跟你们可汗交战，看你们可汗能不能战胜我军！”执失思力听了这番话，哑口无言，只能连连叩头谢罪。萧瑀、封德彝上奏道：“两国相争，不斩来使，还请陛下把执失思力送回去，以表示我们的宽容。”太宗道：“朕如果把他送回去，反而让他更加藐视，岂能轻易纵容？”又对执失思力道，“暂且把你的脑袋寄存几天，让你看看朕领兵亲征，究竟谁胜谁负！”执失思力已经吓得说不出话来，只好跪着磕头，左右侍卫把执失思力拖起来押了下去。
太宗召集禁军，亲自出马讨伐突厥，又带上高士廉、房玄龄等人，直奔渭水。颉利可汗正在营中坐等执失思力回报，忽然探马报道：“唐天子来了！”颉利连忙上马出营，隔着河一看，只见对面来了六个人，为首的盔明甲亮，正是先前的秦王，现在的中原天子李世民。只听唐太宗朗声喊道：“颉利可汗！朕与你在幽州定好了盟约，你也曾立下盟誓不再进犯。近年来却屡次违约，朕正要兴师问罪，你却带兵来犯，难道是来送死的吗？”说完又扬鞭指着空中道：“皇天在上，我国并不曾负可汗，可汗却偏偏负我国，负朕就是负天，试问可汗担当得起吗？”颉利听了这番话更觉害怕了。随身带着的兵士向来迷信神鬼，再看唐天子威风凛凛，都吓得伏身向太宗下拜。不大一会儿，忽听得鼓声震天，大队唐军迎面杀到，在对面摆成了一字长蛇阵，气势如虹。颉利吓得面如土色，连忙回了大营，紧闭辕门不敢出战。
等了一会儿，突厥又派出一个使臣，过河向太宗求和。太宗斥责一番，来使只是俯首听命，太宗令颉利次日来订立盟约。第二天，太宗亲自来到城西与颉利会面，二人就在便桥上面，用白马祭天，歃血立约，颉利乖乖地接受了条件。盟约定好之后，颉利退兵，太宗这才命令把执失思力放回去。
萧瑀向太宗请教道：“突厥大举进犯，为什么一见陛下就乖乖地退兵了呢？”太宗道：“朕看突厥的兵马虽然多却不严整，君臣上下不过是些贪财的家伙。当他们请和的时候，只有可汗站在那里，他的手下大多在参拜朕。如果朕摆下酒宴来引诱他们，再趁他们醉酒的时候绑住，然后发兵袭击，必定势如破竹。再派长孙无忌和李靖在幽州埋伏，截断他们的归路，管教他全军覆没，片甲不留。不过朕刚刚即位，国家尚未安定，百姓还不富足，不愿大动干戈。所以朕用金银财宝收买他们，突厥得了金银，自然退兵。而且他们骄傲自大，一定不再加强军备，这样我们就可以养精蓄锐，将来必能一举歼灭突厥。这就叫‘将欲取之，必先予之’，这种计策难道爱卿不晓得吗？”萧瑀再次下拜道：“陛下神机妙算，愚臣望尘莫及呀。”颉利可汗回国后，献上三千匹马，一万头羊，太宗并未接受，只是要求放回所抢走的中原百姓。
后来，太宗亲自带领将士在殿前习武，并教导他们说：“突厥侵袭中原，由来已久，之所以剿不灭，主要是因为边境稍微安宁，天子便贪图享乐而忘了武功，所以贼寇再来进犯就没人敢出马。如今朕不让你们修筑城池，只让你们练习骑马射箭，没事的时候，朕可以给你们当教头，突厥入侵的时候，朕就是你们的统帅，这样我国人民就可以安定了。”从此每天散朝，太宗都要教侍卫练习骑射，并且亲自考核，严格赏罚。有大臣担心：“按照朝廷的法律，兵刃不可带到殿前，现在陛下带领侍卫习武，万一有人图谋不轨，后果不堪设想啊。”太宗微笑道：“帝王把四海之内当做自己的家，把全国人民看做自己的孩子。朕对他们推心置腹，他们感激还来不及呢，有什么可怕的？朕怎么能猜忌身边的侍卫呢？”将士们听到这些话，更加感动，不到几年就练成了精锐部队。
太宗又为改元做了大量的准备工作。比如：修订旧制度，创立新礼法，确定官职封号。太宗把宗室郡王降为县公，立儿子李承乾为皇太子，封张元素为侍御史，提升张蕴古为大理丞，虚心纳谏，励精图治。转眼间就是腊月，太宗将下一年定为贞观元年。元旦这天，太宗率领文武百官先朝拜太上皇，然后到御殿接受朝贺。第二天大宴群臣，命令演奏《秦王破阵乐》。太宗对群臣道：“朕从前奉命出征，民间就有了这支曲子。虽然不敢说文德，但武功是我大唐建功立业的根本，不能随便忽略，所以朕才命令奏这支曲子。”封德彝奉承道：“陛下凭着神勇扫平海内，文德怎么能形容得了呢。”太宗道：“平乱靠武功，治国靠文德，文武两种手段应当互补运用，你说文不如武，难道马上得天下就可以马上治天下吗？”封德彝碰了一鼻子灰，羞愧难当。大臣们又喝了几杯，才各自散席，谢过了宴，鱼贯而出。
罗艺受封燕王之后，在征讨窦建德、刘黑闼时，立了不少战功，后来又加封左翊卫大将军。于是渐渐地骄横起来，越来越目中无人。高祖担心他在京城惹事，正赶上突厥侵犯边境，就想借他的名气去镇压一下，于是特别任命他为天节军将，出兵泾州。太宗即位后，升任罗艺为开府仪同三司。罗艺因为以前曾经得罪过秦府中的人，心里很不安，有意谋反。借着阅兵之名，罗艺调集兵马，谎称奉密诏进京，竟然带着大队人马直奔幽州。幽州刺史赵慈皓出城迎接，罗艺领兵进城，同赵慈皓商量要背叛朝廷，把幽州据为己有。赵慈皓假装赞成，暗中却派人上奏，一面又和统军杨岌密谋诛杀罗艺。太宗听到上报，就派长孙无忌和尉迟恭两个人领兵去讨伐罗艺。大兵刚出发，罗艺就得到了消息，暗地里一调查，才知道是赵慈皓告的密，于是把他押进监狱。当时杨岌已经召集大军，趁罗艺不备，攻进城中。罗艺仓皇出战，被杀得大败，于是扔下妻儿，只带了几百名亲兵投奔突厥。逃到宁州的时候，手下亲兵渐渐地散去，只剩下几十个人，他们看到罗艺山穷水尽，干脆把他杀死，将首级送到京师。长孙无忌和尉迟恭到幽州的时候，罗艺已经被剿平，他们便把罗艺的家眷押送到长安，一股脑儿斩首示众。
幽州都督王君廓，因为长史李玄道曾经依法裁制自己，怀疑是朝廷的授意，也起了谋反之心。太宗听说他不守法度，就召他进京。走到渭南的时候，地方官对王君廓有些不恭敬，他竟然把人家杀死，然后投奔突厥去了。谁知半路上被野人杀掉，人头也被送到京城。太宗考虑到他先前立下战功，特别命人将他的尸体收回来安葬，还抚恤了家属。后来御史大臣温彦博上奏，说王君廓属于叛臣，不宜给予优抚，太宗才把他的家属废为庶人。