剑（刀）
剑（刀）是日本武士荣誉的象征。武士一般佩带两把剑（刀），长的叫大刀，短的叫短剑，都是用高碳钢千锤百炼而成，刀刃薄的可做绕指柔，但又坚硬的可穿甲盾，说它削铁如泥是毫不夸张的。据说二次大战后，美国军队曾用来复枪的枪管招架短剑，结果来复枪的枪管竟被短剑削去。
忍者所用的刀却比短剑还要短些，仅24英寸[60.96厘米]，刀身多为直身，护口一般为方型，质量也远比武士的刀差，刀刃也钝的多。因此忍者的刀不是用来砍削的，而是以刺为主。如果忍者与武士都用自己的刀对抗，忍者显然处于不利的地位。忍者若要取胜，不得不采取其他手段。
2、棒
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棒（Bo）是人类最原始的革命性武器。说它有革命性是因为它的性能远比石块或经粗糙加工的石镖、石枪优越。石块一经抛掷出去，手中便失去了武器。而棍棒取材方便{随便撅一根树枝即可}，利于近战，又可投掷。忍者有鉴于此，将棍棒视为最重要的武器之一，并发展了一系列使用棍棒武器的方法和技巧，名之为“棒术”。
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忍者使用的棒一般直径为2英寸，长度约5英尺：用硬木制成的棒是实心棒。实心棒有强大的威力，一旦被实心棒击中难免筋断骨折，如击中要害部位，危险性就更大了。空心棒份量较轻，看起来危险性小一些，然而空心棒更有其险恶之处。一般对手万万想不到，忍者的手腕轻轻一抖，藏在空心棒的空心中的铁弹、飞刀、短箭之类的暗器就会直取敌手的咽喉或前心。空心棒中还能藏5-6英尺的铁链，以棒中撒出来的铁链能出其不意地将敌手缚住。
与棒相匹配的武器为杖（Jo），长度约2英尺（70厘米左右）；它是一种出色的防御武器，可以劈、砍、刺或投掷，用来对付手持匕首或短刀的敌手。
3、弓箭[bow]
忍者使用的弓分为大弓和小弓两种。大弓用于远射，小弓用于近射。除射箭外，还能射火箭、响箭、开花箭（一种能爆裂作响的箭）等用来骚扰敌人。现代忍者有了手枪，弓箭就显得累赘不便。只有一种吹弩沿用至今。吹弩的吹管里藏有钢针，用力一吹，钢针便发射出去，但发射距离仅两三米。
箭头经常喂有毒药，也是为了更有效的打击敌人，并且女忍者更是弓箭使用的专家。
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