杨过知道那天外遮天大阵虽有鸿钧舍身并已用混沌鼎补全，但只怕也抵挡不了多少时间，因此在与家人小聚了几天之后，立即进入仙府闭关，再度修炼大道神功【混沌决】。
进入仙府秘境深处，仍把时间调整为外面一天，而里面已是一个量劫的时间，然后找了一处因狂暴的混沌能量相互挤压交错等运动而自然形成的大火山，还离着多远，就见那万丈高的火焰把这一方空间都映成了红色，这还是杨过在离那里有不下一亿里的距离的情况下，杨过已感到浑身发热，有点象冬天靠近火炉子的感觉，越住前走，感到越热，这可是先天混沌之火，走了近五干万里，此时的杨过已然是浑身大汗，就象从水里捞出的一样，那脚下的土地都已经热得烫脚，杨过深深吸了一口炙热的浑沌灵气，仍然向着火山靠近，这五千万里的路程，杨过竟用近五千万年的时间。再往前走，杨过身上滴下的汗水落到地上立刻“嘶”得一声化作了烟雾，现在杨过已经有了窒息的感觉，浑身的衣物早已成了灰烬，浑身上下不着寸缕，全身都被考得通红，那锥心的疼痛刺激的杨过不住地眨着眼睛，但他也只能忍着，依然抬起****的双脚向前走去，这次他只走了三千万里，但这三千万里的路他却用了整整四亿五千万年的时间。杨过站在那里，调整着体内的混沌本源不断修复着烫伤的身体，他不能动用身化万物之法，那样就达不到修炼的效果。
定了定神，一咬牙，杨过抬脚继续前行，那如烧红的铁板一样的地面立即把他双脚的脚底板上的皮粘了下来，“哧”得一声，杨过原来所站之地立即升起两团红色的火雾，现在整个空间的灵气都变作了火红色，杨过身上的肌肉开始一块块地掉了下来，化作一团团的红雾飘散在空中，露出了里面如玉一般的骨骼，在那骨骼上流光闪动，顿时一层新的肌肉以肉眼可见的速度又长了出来。就这样，掉了又长，长了又掉，杨过仿佛已忘记了疼痛，他现在已完全沉寂在这种生与死，毁灭与创造的玄之又玄的境界当中，就这样，杨过一步一步向前走去，他走的并不快，甚至还不如以前快，一亿年，五亿年，十亿年，二十亿年，三十亿年，一百万里，五百万里，一千万里，二千万里，杨过走过这最后的两千万里整整用了三十亿年的时间，杨过终于来到了火山口，此时的杨过，身上的肌肉仍然是一块块的掉落，但与以前不同的是，此时杨过掉落下来的肌肉，掉在地上不但不再变作红色的烟雾，而且与地面一接触竟发出“嗵”地一声，沉重至极的样子，一块快都里静静地躺在地面上发出泠幽幽的金黄色光茫。这炙热至极的先天混沌之火竟然没有将其点燃炼化，其实杨过不知到的是此时他掉落下来的这些肌肉如果被一炼器大师得到，那么一定会被视为顶尖的炼器之才。
其实杨过到了这里脚步并没有停下，而是一脚踏入了了那冒着汩汩岩浆的的火山口，顿时不见踪影，被里面汹涌的岩浆覆盖了起来，天地间好像失去了杨过这个人，其实不然，如果仔细往岩浆深处看去，此时的杨过竟然连骨骼也已不再存在，而变作了一个闪着无比亮光的亮点，这个亮点是那么的亮，比那岩浆发出的火光还要亮，比那天上的太阳也不知亮多少倍，它就那么一直漂浮在那些岩浆当中，五亿年，十亿年，二十一年，直到二十亿年后，突然那个亮点在岩浆中掀起滔天火浪，顿时一道无比明亮之光影自那岩浆中****而出，但到了空中后，那个光点一下子发出五颜六色的混沌神光，那些混沌神光不停的旋转起来，一直到近一千万年后，忽然一声长啸自那混沌神光中传来，顿时混沌神光消散殆尽，空中盘坐一人，此人浑身金光涌动，佛若那西天中的佛佗一般。只几此人身形一转，顿然在原地凭空消失不见，再出现时已然是亿万里之外的混沌之中，只见此人剑眉朗目，鼻直口方，不是杨过又是何人，杨过此时己用混沌灵气幻化了一件衣服穿在身上，回想起前些时候修炼的情景，也是暗自感到庆幸。
原来在向火山口行进的途中，当杨过身上的肌肉开掉落的时候，那刺骨的疼痛既使杨过也是紧咬牙关，正在难以忍受的时候，附着在骨骼上的造生细胞开始分裂，顿时骨骼上一阵莹光流动，新的肌肉组织开始形成，此情此景，杨过忽然想到肌肉掉下是毁灭之力，而细胞分裂则可称之为创造之力，毁灭与创造同在，这不正符合太极的阴阳转换之理吗？毁灭为阴，而创造为阳。阴至为阳，阳极为阴，阴阳转换，生生不息。想到这里，杨过完全放弃了抵抗，任那热浪席卷在身上，不去感受疼痛，只管一直往前走，此时他的头脑中到出现了佛家常说的那四句诗：菩提本无树，明镜亦非台。本来无一物，何处惹尘埃。这佛家至理与杨过此时的心境不谋而合，顿时杨过陷入了那种玄而又玄的境界。此时的他不去感觉疼痛，任身上肌肉自生自灭，脚步只是一个劲的往前，往前。当进入了火山口以后，他做了一个梦，梦见自己被一场大火烧成了灰，只留下了神识，而神识变作了一粒种子，好像大火把世间的一切都已烧毁，只留下自己这一粒种子，也不知过了多少年，自己这粒种子不断汲取着光的能量，不断的生长，继而细胞又在种子里面开始了分裂，慢慢形成了胚胎，继续发育，又不知过了多少年，最终这粒种子冲开束缚破皮而出，外面的光的能量一下子又补充过来，这粒种子张开初生的嫩芽欢快的旋转起来，随着旋转这些嫩芽也飞快地成长，最终成长为这天地间一颗唯一的大树。顿时“轰”的一声，无数的记忆疯狂涌来，杨过也自梦中醒来，却已知道自己【混沌决】的第二步已然修炼成功。他也真正明悟了破而后立，不破不立的至理。
这第二步练成后，杨过并没有立即去修炼第三步“水”这一关，而是盘坐于混沌虚空之中静静的感悟前两步的感受，他原先以为这【混沌决】纯属修炼肉身的至高功法，现在想来，却不尽然，在第二步如果自己没有在生与死之间顿悟创造与毁灭的至理，也就不会那么轻易的度过第二步，他知道在火山口内，自己肉身已经尽灭，虽然神识尚存，理论上自己是大道之身，只要神识不灭，那么肉身就不会尽灭。但他知道自己如果不是顿悟了创造与毁灭与太极中阴阳学说之间的关联之处，在关键时刻明悟了不破不立的至理，自己的神识也许用不了多久，就会如烟散去，化归混沌本源，他已明白最后时刻这第二步修炼的后期并不是肉身，而是神识。
杨过掐指一算，修炼第二步自己用了六十多亿年的时间，这可是近一个量劫的时间。杨过盘坐虚空，感悟良久，觉得在前两步的修炼中，自己受益颇多，他对后两部的修炼隐隐有种感觉，就是有了前两步修炼的基础，后两部不会太难。又觉得不管怎样还是先修炼再说，于是抬脚又向混沌深处走去。