在朱元璋活着的时候，他尽心竭力的保卫北方边陲，每年都给父王敬献各种珍玩，山珍海味，特别是人参鹿茸，熊掌，这些东西，是北方的特产，而且由于燕王的治理有方，贡品自然是最多最好的，朱元璋对此非常满意，甚至都想废了太子，立朱棣当太子，但是，这时候朝中的大臣都反对，没有一个赞成的，因为所有人都认定了朱棣是个杂种，包括朱棣本人都觉自己完全不像朱元璋，唯一一个不知道真相的朱元璋，因为他是自认为的真龙天子，自己一向都认为自己是对的，包括生孩子，当他和一个妃子云雨完之后，太监负责把妃子背走，太监会问，这个龙子是要还是不要，他会根据自己的感觉说要还是不要，完全是靠一时的高兴与否，或许他今天爽他说要，那么太监就要想办法让这个妃子怀上孩子，当然不能在劳动皇帝了，那可是真命天子，金口玉言，只能找其他人帮着办这件事，直到怀上为止，血统问题自然就没法保证了，但他肯定那是他的孩子，这是真命天子的自信，想想也够让人不可思议的，但民间一直有这个说法，不光是朱元璋一个皇帝的儿子有问题，好多皇帝都是真龙天子吗，至少他们有自以为是的金口玉言，包括生孩子这个问题上。
当然那如果皇帝说不要，那妃子绝对怀不上孕，即便怀上了也要被打掉，所以，哪有人敢直接告诉朱元璋，朱棣不是他亲生的，是那个元顺帝的儿子，那朱元璋岂不成了王八，被元顺帝给戴了绿帽子，其实本来他给元顺帝戴的绿帽子，反而最终扣到了自己头上，那他皇帝的脸往哪搁呀，所以，事实变成了哑谜，即便是马皇后都不敢跟朱元璋说，尽管她时时刻刻都在想方设法的除掉朱棣，但因为没有朱元璋的支持，朱棣也因此没有被过早的消灭掉，马皇后身在宫中，能力也不能得到施展，让朱棣侥幸保全了他的小命。
马皇后的儿子，接二连三的殒命，朱元璋的身体每况愈下，这时候，朱棣竟然成了最年长的儿子，按说该立朱棣为太子了，可是，这时候，马皇后拼了命的向朱元璋说出了实情，朱元璋如梦初醒，他不能再往下立太子了，否则就是专门的跳过朱棣，那么岂不是给天下人一个笑柄，只能在孙子辈的人中选太子，于是立了朱允炆当太子，他知道朱棣的实力也很强了，不想再起干戈，毕竟父子一场，还是希望朱棣能辅佐朱允炆的执政，保天下太平，人们安居乐业。而且，他喜欢朱棣，虽然别人说他不是自己的儿子，但朱棣对他还是真的有父子之情，非常的敬重他，惦记他，可能也是那个美人的关系吧，把他们紧紧地联系在了一起，心贴的很近，虽然朱元璋没有立朱棣为太子。作为朱棣来说，他没被立为太子，自然生气，但完全没有怪到朱元璋的头上，而是更加的痛恨马皇后了，因为朱允炆是他的孙子吗？他孙子抢了他的皇位，他自然恨她，但并没有太多的野心，毕竟好多的事都不是万事如意的，他这么多年的苦难，能活下来就太不容易了，没有更大的诉求了，只要能独辟一隅，颐养天年就行了，毕竟他已经将近四十岁了。