此时的朱由校避居慈庆宫，但李选侍占据乾清宫却泰然自若。显然，“避居”只能是一时的权宜之计，不能长久如此。朱由校必须尽快回到乾清宫，登临大位，才能稳定局势。而要速回乾清宫，首先必须令李选侍移出乾清宫。也就是说，必须在朱由校避居慈庆宫时，让李选侍“移宫”。所以，从九月初二日起，众大臣的目标就转入到“移宫”上，他们强烈要求李选侍移居哕鸾宫，以便让朱由校定至尊，正名位，防不测。哕鸾宫，在仁寿宫门内，此有喈凤宫，为明代宫妃养老之地。
为了正名位、定至尊，防止李选侍“垂帘听政”，左光斗首先上疏说：“李选侍既不是皇长子的嫡母，又不是皇长子的生母，根本不能居住在正宫。今日反令皇长子偏居慈庆宫，不能为先帝守灵行大礼，于情不顺，于理不合，李选侍必须从速移出乾清宫！”“内廷的乾清宫，就好像外廷的皇极殿，只有天子才能居住，只有皇后才能陪伴皇帝共同居住，其他妃嫔虽然在皇后缺位、伺候皇帝的情况下可以进入居住，但是，不能长久居住，这主要是为了区别尊卑。”
“现在，先帝刚刚升天，李选侍并非嫡母、生母，却占据正宫，却让少主偏居慈庆宫，名分倒置，我实在感到疑惑不解，万分担心。而且现在殿下已经16岁，大内有忠直老成的内官，外廷有公侯大臣辅佐，又不缺人，难道还需要哺乳吗？如果不早早决断，恐怕李选侍要借抚养之名，行专制之实，武后之祸将重现于今朝。”
左光斗的这个奏疏传到众臣中后，朝野轰动，大家都开始担心李选侍会垂帘听政。
“速速召左光斗前来认罪！”李选侍看到左光斗的奏疏以后，愤恨至极，大发脾气，她多次派人去召左光斗。
“我是天子的法官，非天子召我，决不去！李选侍是什么人，敢来召我？”左光斗理直气壮地说。左光斗，字遗直，一字度之，号浮丘，南直隶桐城县（今安徽桐城）人，生于万历三年（1575年），万历三十五年进士，授御史。此时的他刚刚四十六岁，年富气盛，身居御史之职，根本不理睬李选侍。将李选侍气得暴跳如雷。“反了！反了！传太子前来乾清宫！”李选侍乘朱由校入宫守灵时，再次派人把他抓进了乾清宫暖阁之中。“你必须下旨，治左光斗的罪！否则，我的脸面往哪里摆？如果你不下旨，就别想出乾清宫！”
“左光斗的话很有道理，你初五日必须搬出乾清宫！”朱由校现在已经是太子了，过几天就是皇帝了，一贯软弱的他现在开始在这个女人面前强硬起来。他对李选侍一直很反感，与左光斗持有相同的看法，所以就没有屈服。
就在李选侍和群臣就移宫争得不可开交之时，一直两边讨好、不置可否的内阁首辅方从哲很快地露出了自己真正的立场，他说：“皇帝登基大礼吉日尚未择定，李娘娘的移宫期限，缓几天也无妨。”
刘一燝立刻反驳道：“按本朝惯例，仁圣，是嫡母，移居慈庆宫；慈圣，为生母，移居慈宁宫。李选侍什么也不是，岂容再迟缓？”
“对，李选侍必须马上移宫！”至此，众大臣对李选侍移宫的问题终于取得共识。
此时的李选侍既伤心又恼怒。伤心的是朱常洛在世时，她是何等的荣光，将来封贵妃、皇后不过是顺理成章的小事。当时人们对自己千尊崇、万恭敬，可现在皇帝尸骨未寒，杨涟、刘一燝等人竟前来逼她移宫，把自己视为武后（则天），强迫自己立即迁出乾清宫，这是要彻底断绝自己的权力。她的近侍们看到主子伤心并受到冷落，心里也很不服气，但又无计可施，有的看到前途渺茫，甚至开始盘算着自己今后的出路。
这样，从九月初二日这天开始，文武百官就开始纷纷上劝进表，请朱由校早登大位。
朱由校照旧例致歉说：“父皇刚刚驾崩，我现在正哀痛满怀，继统的典礼怎么能够立即就举行？你们的请求我不能允许。”九月初三日，朱由校到乾清宫朝见李选侍之后，送朱常洛的灵柩到仁智殿，行礼完毕，李选侍派人令他必须回去拜见，否则，就不准他回慈庆宫。
朱由校回去拜见时，李选侍却意外地装出了一副可怜相，对朱140由校软磨硬泡。并改变策略，一改以往的强硬骄横态度，对朱由校着实夸奖了一番，说他英明仁爱，作为不小。
朱由校年纪尚小，处事从无定见，常常反反复复。经李选侍这么一说，对她的态度就变化了。
“请殿下下旨令李选侍速速移出乾清宫，肃清宫禁，以安国家。”这时，朱由校接到了周嘉谟和左光斗等人的联合上疏。李选侍却仍想赖在乾清宫不动，她和贴身内侍们又商量出了一个拖延的主意。她让内监向外散播谣言说：“近日天象示警，移宫不利，必须延期！”
这时，廷臣之间也有不同的声音，以首辅方从哲为首的浙党官员认为移宫固然应该，但“迟亦无害”，让她晚点搬又有什么害处呢？何必催促那么着急呢？于是，齐党、楚党官员也纷纷上疏支持这一观点，抵制周嘉谟、杨涟、左光斗的做法。双方展开了激辩。
16岁的朱由校对李选侍天象示警的说法信以为真，就说：“移宫需择吉日举行。”朱由校见李选侍改变了强硬的态度，不忍心将她立即赶出乾清宫，就决定和她做交易，命礼部重新研究进封李选侍之事，好让她早早搬出乾清宫。
“这是个阴谋，殿下绝不能答应！”由于廷臣们的反对，李选侍的阴谋又一次被粉碎。
九月初四日，朱由校在午门颁布了朱常洛的遗诏。诏书要朱由校早日继位称帝，亲贤、勤学、立政、安民。
文武百官于当天第三次上表，请朱由校务必尽快登基。朱由校这才下诏说：“群臣们再三请我早日继位，你们的忠恳我已经知道。天位至重，确实不能空缺。况且有先帝遗命在身，不敢固辞，现在勉强接受你们的请求。”接着，又下旨命令礼部选择吉日良辰奏报。最后定于九月初六日举行登基大典。
与此同时，李选侍也在加紧谋划对策。这天，她令心腹魏进忠去慈庆宫把朱由校骗回乾清宫。魏进忠和朱由校的乳母客印月都是从小陪着他长大的，他常常带着朱由校玩耍，他能变出许多花样，让朱由校着迷。对于多才多艺的魏进忠，朱由校印象挺不错。果然，一番甜言蜜语之后，朱由校跟着魏进忠回到了乾清宫。李选侍又生一计，他派魏进忠等人扬言要逮捕杨涟和左光斗。王安得知此消息，感到大事不好，故意虚张声势，到处扬言，以激起群臣的义愤。
此时，杨涟恰巧在乾清宫门外遇到魏进忠，杨涟将计就计，佯装不知王安说了些什么，问魏进忠说：“李选侍何时移宫？”魏进忠十分得意，摇头晃脑地说：“李娘娘非常生气。今天，母子同在乾清宫中，正准备研究追查左御史所谓武后专制之说呢！”
杨涟怒吼道：“皇长子今日非昨日可比，只要李选侍移宫，进封之事，日后自然少不了。况且少主已经长大了，难道你们不害怕吗？”魏进忠沉默不言，悻悻而去。
这时，给事中惠世扬、御史张泼等人从慈庆宫门前飞步跑过来。张泼贴在杨涟耳边，神秘地说：“听说今天李选侍要垂帘听政，逮捕左光斗。”
“绝对没有这事。”来回走了几步，杨涟又说：“少主必须依原定日期登基，决不容再更改。”
李选侍见自己吓唬的计谋被杨涟识破，君臣们要她移宫的态度坚决，只好做好移宫的打算。
九月初五日一大早，李选侍却依然毫无移出乾清宫的意思。杨涟、刘一燝等人忍无可忍，愤怒至极，纠合了很多大臣在宫外喊话，请令李选侍急速奉旨移宫。
吏部主事吕维祺进言：“皇位不可长久空，大宝亟宜早嗣，四轿不可轻动一步，女侍不可杀进一人。内阁和六部各衙门，必须防微杜渐。内官要选择忠厚老成之人。明天皇上就要登基，李选侍应赶快移宫，不可再迟延。”
杨涟的奏疏说得更为激烈：“先帝驾崩，人心不安，都说李选142侍俨然以太子之母自居，表面上说要保护太子，实际上要行专擅之实。所以，力请殿下暂居慈庆宫，然后再回驾乾清宫。祖宗家法以国家为重，宫廷恩怨为轻。明天太子就要登基，难道要皇上明天在东宫登基吗？我认为李选侍今天必须移宫，殿下今天也应该随即搬入乾清宫。阁部大臣都应该在今天支持殿下完成移宫大事。”
这时，众大臣都聚集在慈庆宫门外，等待朱由校下令。
而朱由校待在慈庆宫里，一言不发，思想斗争非常激烈。在这个东宫，他领教过李选侍的照管，吃过她的苦头，担心她“垂帘听政”，会捆住自己的手脚。但对现在遇到的一方不移宫，一方非要移宫不可的对峙情况，他又觉得无能为力，看到杨涟等人的奏疏，他的情绪才开始慢慢安定下来，认为他们说的话非常公正、真诚，是一心要辅佐自己早日完成登基大典。
上完奏疏，杨涟又劝方从哲一定要按原定的时间于明天举行登基大典。
方从哲见杨涟前来求自己，不由又强硬了些。他再次变卦，重弹老调：“移宫之事何必这么着急？初九和十二日都是黄道吉日，等到这两天移宫也不晚，迟延几天有什么害处？”
杨涟怒视着他，斩钉截铁地说：“昨天，皇长子居住在东宫还可以，明天就要继位为天子了，怎么可以仍然偏居东宫，以避宫人？当今天子决不能像先帝一样，再回东宫举行继位大礼。即使是两宫皇太后活着，夫死也应当从子。李选侍是什么人？敢这样欺负藐视圣上？今日非移宫不可！”
这时，魏进忠和一帮太监都尾随而来，他们围着杨涟，气氛异常紧张。
魏进忠斥责杨涟道：“先帝尸骨未寒，你们就不念先帝的旧宠，是何道理？”
杨涟针锋相对地辩驳道：“我们是先帝册选的顾命大臣，先帝自己想先顾他的儿子，怎么能先顾他的妾？你们是不是吃了李家的俸禄，才如此为她叫冤？今天，你们要有胆量，就在这里先杀了我！否则，今天李选侍不移宫，我就决不离开这里！”
“对，我们就不离开这里。”刘一燝、周嘉谟等其他大臣也坚决支持杨涟，言辞激烈、态度严厉。
见众大臣纷纷怒气冲冲地责问李选侍，太监们吓得直往后躲。李选侍也吓得不轻，她经受不住强大的舆论压力，决定从乾清宫搬出来。
朱由校高兴起来，他立刻派人传旨：“先帝选侍李氏等，着于仁寿宫居住，即日搬移。”
无可奈何花落去，李选侍在一片责骂声中，咬牙切齿地离开了乾清宫，移居哕鸾宫。因为时间仓促，她来不及等待侍从，自己抱着女儿（即八公主）徒步从乾清宫走到专供妃嫔养老的哕鸾宫。
同时，皇长子朱由校带着王安等内侍和群臣由慈庆宫搬回乾清宫。
九月初六日，朱由校登基典礼正式进行，定万历四十八年八月初一日以前为万历四十八年，八月初一日以后为泰昌元年，第二年为天启元年。
从光宗朱常洛驾崩，到熹宗朱由校登基，前后共有六天。杨涟与刘一燝、周嘉谟平定国家的危险和疑难。言官只有左光斗协助他，其余的人都听从杨涟的指挥。
六天来，杨涟日夜忧思，头发、胡子全都白了。朱由校多次称他为忠臣。不久，提升兵科都给事中。
当李选侍移官的时候，杨涟就对各大臣说：“李选侍不移宫，不能表示尊敬天子。移宫之后，又应当采取措施安抚李选侍。这事在于各位的调停处理，不要让宦官利用这事发泄私仇。”不久果然流言飞语四起。
13、案中案——魏忠贤到底有没有参与盗宝案？
九月初四日，李选侍的贴身太监魏进忠来到李选侍面前挑唆说：“刘一燝和杨涟吃着皇上的俸禄，干的却是违背皇上心意的勾当，今天我们在这里生气悲伤又有什么用？总得想个对策。”
“目前，我们还能咋地？”
魏进忠说：“我们如果两手空空地搬出了乾清宫，也太便宜了他们。乾清宫是皇上的住所，这里的一切都是皇上最喜欢的。现在皇上殡天了，于理于法这些宝物（这些宝物不少是郑贵妃在朱常洛登基时所献）都应归李娘娘所有。娘娘今后才好指望这些东西养老。”
“可是，这里宝物甚多，公开来拿，恐怕不妥吧？”
“运送宝物必须特别秘密地进行，但要抢在天子入住乾清宫前完成。看来，明天我们已经非移宫不可了，这件事可安排在今天深夜。如果刘一燝等人再催促今天移宫，就说移宫是大事，必须查个黄道吉日方可。”魏进忠的这番话，使李选侍豁然开朗。“那你就负责这件事吧，另由刘逊、刘朝、田诏、王永福、卢国相等人协助你。”
看到李选侍同意了自己的意见，魏进忠不觉暗自窃笑。这下，自己便可从中浑水摸鱼，发一笔横财了！
九月初四深夜，天空中没有月光，几处必经路口的路灯事先都被魏进忠给弄灭了，周围漆黑一团。