埃及在历史上曾经多次遭受过外来军队的侵略和奴役，但是遇到像波斯这样的强敌的征服和压迫，遭受如此严重的民族屈辱还是第一次，埃及人民以连续不断的起义回敬侵略者。
公元前525年，波斯国王冈比西斯的军队进入埃及，围攻首都孟斐斯。不久，埃及海军舰队司令官乌加霍列森尼开门揖盗，孟斐斯被攻陷。冈比西斯给自己加了一个法老的头衔，将埃及划为波斯帝国的一个行省。
埃及人的屈辱埃及人有着自己的传统信仰，波斯人以征服者的姿态出现在尼罗河两岸，根本不考虑埃及人民的宗教感情。冈比西斯在检阅自己的胜利成果时，发现幸存的人们正在举行庆祝活动。当他得知就在波斯军队占领这座城市的同一天，新的阿匹斯神被找到了，他爆发出一阵大笑。在庆功宴会上，他杀掉了这头牛。从此，人们把这一亵渎神灵的行为解释为以后降临到埃及人头上的每一个灾难的渊源。
神通广大的埃及神灵们面对异族的入侵及其宗教侵略束手无策，只能与僧侣、祭司们躲在寺庙厚重的大门和石墙背后。
冈比西斯蔑视埃及人的信仰，他没收寺庙财产，毁灭神庙，逮捕僧侣，采用恐怖屠杀的政策来对付人民的反抗。冈比西斯的继承人大流士对埃及宗教的态度有所缓和，他命令恢复神庙，向埃及神致祭，但是对埃及人的防范仍然很严，他在碑文中傲慢地说：“我是波斯人，我征服了埃及”。阿塔薛西斯三世在位时大肆破坏神庙建筑，劫掠圣物，甚至把普塔神殿改为驴马圈以发泄他对埃及人民的愤恨。
沉重的负担埃及作为波斯的一个行省，每年要向波斯交纳700塔兰特银子，还要交纳一定数量的谷物。为了军事和商业的需要，大流士在尼克之后完成了尼罗河和红海之间的运河。大流士说：“我命令挖掘这条运河，从流经埃及的尼罗河到波斯开始的红海，正像我命令的那样，在这条运河挖掘成后，战舰由埃及经过这条运河到达波斯。”运河长达84公里，完全是为了波斯对埃及的控制服务的，在开挖运河中，征发了大量的埃及民众服役，增加了人民的负担，最后死于挖掘工程的人有12万。
反侵略斗争埃及虽然在波斯人强大的军事进攻下失败，但是反对外国奴役的斗争从来没有中断。
冈比西斯从埃及出征努比亚和利比亚时，埃及人民乘机起义，被废黜的法老普撒美提克也积极参与，在被抓获后，他毅然自杀殉国。
公元前522年，冈比西斯去世，埃及人民起义的怒涛再次涌起。
在波斯进攻希腊的马拉松战役爆发后，埃及人民乘着他们对埃及监管的放松，发动了反波斯人的大起义。这次起义的直接原因是沉重的税务负担和无尽的劳役。大流士还没有来得及镇压起义就去世了，他的儿子薛西斯残酷镇压了起义，他还将许多神庙财产没收，被埃及祭司们称作“坏蛋”。
波斯统治者藐视埃及宗教信仰，肆意掠夺埃及人民财产，使埃及人民的反抗情绪不断高涨。公元前460年，在伊纳罗斯和阿米尔塔伊俄斯的领导下，再度发生了大规模的起义。起义者与其他国家的反波斯力量结盟，共同抗击波斯人。伊纳罗斯与雅典人联合围攻孟斐斯的波斯军队，给波斯人很大的震动。起义者在遭受严重挫折后撤退到西三角洲继续战斗。
公元前454年，波斯大军进攻西三角洲，伊纳罗斯被俘牺牲，阿米尔塔伊俄斯继续领导人民坚持斗争。敌人有40万大军和80艘军舰，主帅是波斯国王的弟弟、埃及总督黑明。勇敢的埃及人民不畏强敌，利用有利地形与敌人展开周旋，将20艘敌舰击沉，全歼这些军舰上的敌人。最后黑明战死，波斯军队惨败，波斯被迫同意埃及人担任总督和其他一些职务。
虽然这次大起义没有从根本上动摇波斯对埃及的统治，但是取得的胜利鼓舞了埃及人民。此后，埃及人民继续发动起义，为赢得国家独立而斗争。公元前338年，尼罗河三角洲爆发了最后一次反波斯大起义，起义由当地统治者哈巴巴什领导，可惜又以失败告终。埃及人民只能把希望寄托在另一支能够战胜波斯人的外国力量上，希望他们能够帮助自己取得解放，6年后，亚历山大打败了波斯人，终于解放了埃及。
